O Programa COPAÍBAS segue as diretrizes do FUNBIO em relação à transparência e reconhece sua importância como um princípio orientador de sua atuação. Uma das formas de promover a transparência é estar aberto a reclamações de pessoas que se sentem afetadas pelas operações e projetos do  FUNBIO, assim como de denúncias de quebra do Código de Ética da instituição ou infrações à legislação brasileira. 

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Você também pode acionar os seguintes canais para reclamações e denúncias: